Поступивший в редакцию журнала рукописи проходят процесс первичной оценки с точки зрения соответствия формальным требованиям: тематике журнала, правилам оформления статей и оригинальности. При поступлении рукописи редакция журнала может произвести проверку материала с помощью программных средств.

Статьи, не соответствующие формальным требованиям, не регистрируются и не рассматриваются, их авторы ставятся в известность о принятом решении.

Все зарегистрированные статьи подлежать обязательному двойному сплошному рецензированию (имена авторов и рецензентов не раскрываются друг другу) и направляются по профилю исследования одному, а при необходимости — двум рецензентам. Каждый рецензент обязан отказаться от рецензирования в случае наличия явного конфликта интересов, отражающего на восприятии и интерпретации материалов рукописи.

После получения рукописи рецензент осуществляет ее рецензирование в соответствии с установленной редакционной коллегией формой экспертной оценки, руководствуясь предлагаемой памяткой рецензента (пример: Экономические и социальные перемены,  Russian Journal of Economics).

Рецензия предполагает  оценку статьи по следующим критериям: соответствие тематике статьи научному профилю журнала; актуальность выбранной темы; наличие обзора литературы, достаточного для формулирования теоретической проблемы; общий анализ научно-исследовательского уровня, отражающего приращение знаний; аргументированность изложения и выводов, в частности соответствие использованных автором методик, рекомендаций и результатов исследований современным достижениям науки и практики; соответствие названия и качества аннотации  статьи ее содержанию.

На основании вышеуказанного анализа рецензент делает вывод о возможности публикации, а также выдает (при необходимости) рекомендации, включающие уточнения представленных результатов исследования, дополнения предлагаемого для опубликования материала и т.п.

Окончательное решение о принятии статьи и размещении ее в одном из номеров журнала принимается на заседании редакционной коллегии журнала.

В случае положительного решения о публикации статьи в Журнале экономической теории редакция информирует автора о принятии статьи к публикации с указанием сроков публикации.

Утвержденная к публикации статья, предоставляется техническому редактору. Незначительные исправления стилистического или формального характера, не влияющие на содержание статьи, вносятся техническим редактором без согласования с автором. При необходимости или по желанию автора рукописи в виде макета статьи возвращаются автору для одобрения.

В случае принятия отрицательного решения о публикации статьи редакционная коллегия информирует о принятом решении автора в соответствии со сроками рассмотрения статьи.  В этом случае автору статьи редакционная коллегия направляет копии рецензий или мотивированный отказ.

Если рецензент указывает на необходимость внесения в статью определенных корректив, статья направляется автору с предложением учесть замечания при подготовке обновленного варианта статьи. После доработки статья рассматривается повторно. В случае несогласия с мнением рецензента автор статьи имеет право предоставить аргументированный ответ в редакцию журнала. В таком случае статья рассматривается на заседании рабочей группы редакционной коллегии. Редакционная коллегия может направить статью для дополнительного или нового рецензирования другому специалисту. Редакционная коллегия оставляет за собой право отклонения статей в случае несостоятельности аргументов, представленных автором, или его нежелания учесть рекомендации и замечания рецензентов.